据市交通局规划建设科负责人介绍，“十三五”期间防城港市将新建万吨级以上泊位43 个，新建和扩建航道79公里，同时，抓好渔氵万港区升级改造和企沙港区建设，加快建设40万吨级码头及配套航道。到2020年，全市港口货物吞吐能力将达 3.2亿吨，集装箱年吞吐能力达300万标箱。

　　深水航道建设。坚持航道与泊位同步建设、同步投入使用的原则，推进新开发港区、作业区进港航道建设。重点推进第五作业区、第六作业区、潭油作业区、企沙南作业区和企沙东港区进港航道建设，适时启动三牙航道、东湾航道和西湾航道通航等级提升建设工作，至2020年建成广西首条40万吨级进港航道。

　　港口运营和港航服务体系建设。着力提升港口运营能力，加快完善港航服务体系。建设集港口通关、航运服务、物流信息、船舶经纪、金融保险服务等于一体，具有政府管理服务、港航及关联企业集聚运营、信息集散等功能的航运服务集聚区，吸引国内航运企业及航运服务企业到防城港市落户，加快形成和提升防城港市在航运服务业的竞争力。推进港口物流和电子商务平台建设，构建集货运信息交易、联运业务办理、仓储物流服务、综合商务服务等功能于一体，辐射西南、中南地区和东盟国家的区域性物流交易中心。加快口岸通关便利化建设，实现主要港区口岸全面开放，优化口岸环境，提高口岸通关效率。